Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot1Q6ZQ08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms