Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228bQ497Q6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228bQ497Q6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms