Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf6Q3TWW8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms