Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms