Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RptnP97347 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RptnP97347 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RptnP97347 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RptnP97347 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RptnP97347 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RptnP97347 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RptnP97347 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RptnP97347 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms