Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl9P51670 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms