Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms