Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms