Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms