Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01725 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01725 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01725 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01725 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01725 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01725 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01725 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01725 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01725 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01725 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01725 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms