Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.5 ms