Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a3A2ACT7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a3A2ACT7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms