Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edf1Q9JMG1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms