Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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Hmgn5Q9JL35 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Hmgn5Q9JL35 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Hmgn5Q9JL35 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Hmgn5Q9JL35 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Hmgn5Q9JL35 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgn5Q9JL35 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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