Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AatfQ9JKX4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AatfQ9JKX4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms