Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Extl1Q9JKV7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms