Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms