Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx6Q9ER75 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms