Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms