Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtpbp4Q99ME9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms