Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrrdQ8K2M3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms