Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snapc4Q8BP86 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snapc4Q8BP86 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms