Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms