Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med16Q6PGF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms