Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2surpQ6NV83 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2surpQ6NV83 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms