Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NipblQ6KCD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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