Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trappc10Q3TLI0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms