Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms