Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga1P29974 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga1P29974 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms