Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lama1P19137 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lama1P19137 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lama1P19137 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms