Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01725 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01725 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01725 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01725 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01725 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01725 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01725 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01725 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms