Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc1O88447 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc1O88447 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms