Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2f6O54917 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2f6O54917 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms