Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rabep1O35551 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabep1O35551 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms