Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad7O35253 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad7O35253 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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