Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8444F6XS56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8444F6XS56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms