Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms