Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc1E9PZP8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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