Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf1B2RRD7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms