Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms