Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Knop1Q9Z2Q2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms