Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms