Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edf1Q9JMG1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edf1Q9JMG1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms