Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgn5Q9JL35 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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