Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms