Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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