Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms