Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znhit3Q9CQK1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znhit3Q9CQK1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms