Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms