Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsun3Q8CCT7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsun3Q8CCT7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsun3Q8CCT7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsun3Q8CCT7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsun3Q8CCT7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nsun3Q8CCT7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Nsun3Q8CCT7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Nsun3Q8CCT7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Nsun3Q8CCT7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsun3Q8CCT7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms